Perfiles bioquímicos atípicos de cepas de Escherichia coli de origen ambiental mediante el empleo del sistema Entero Well D–One / Atypic biochemical profile of environmental Escherichia coli strains using Entero Well D-One system

Resumen

Escherichia coli es miembro de la microbiota normal del intestino de los mamíferos y debido a su versatilidad metabólica puede sobrevivir en ecosistemas naturales. La supervivencia de E. coli en ecosistemas acuáticos requiere que este microorganismo se sobreponga al estrés ambiental. Aunque se realizan múltiples investigaciones para la evaluación de la prevalencia de E. coli en el ambiente como indicador de contaminación fecal, son pocas las que se enfocan en el estudio de las características fenotípicas de las cepas ambientales de este importante microorganismo. Teniendo en cuenta estos aspectos, la presente investigación tuvo como objetivo determinar los perfiles bioquímicos de cepas de        E. coli aisladas de ambientes acuáticos mediante el uso de pruebas convencionales y el sistema comercial Entero Well D–One. Se trabajó con  61 aislados de E. coli procedentes de muestras de agua de los ríos Almendares, Quibú y Luyanó, en La Habana, tomadas desde septiembre de 2017 hasta enero de 2018. El 90,1% de las cepas se confirmó como E. coli por ambas metodologías. Se obtuvieron un total de 27 perfiles bioquímicos diferentes entre las cepas. El 63,6% presentó perfiles atípicos debido a la      reacción negativa de las pruebas bioquímicas producción de la enzima     ß-D-galactosidasa, descarboxilación de los aminoácidos lisina y ornitina y utilización del sorbitol. La presencia de cepas de E. coli con perfiles bioquímicos atípicos pone de manifiesto que en las aguas de los ríos de La Habana se podrían encontrar patotipos de E. coli y por tanto el uso de estas aguas implica un riesgo higiénico-sanitario. 

ABSTRACT

Escherichia coli is a member of the normal microbiota of the gut of mammals and due to its metabolic versatility it can survive in natural ecosystems. The survival of E. coli in aquatic ecosystems requires this microorganism to overcome environmental stress. Although multiple investigations are carried out to assess the prevalence of E. coli in the environment as an indicator of fecal contamination, few focus on the study of the phenotypic characteristics of the environmental strains of this important microorganism. The objective of this research was to determine the biochemical profiles of E. coli strains isolated from aquatic environments with conventional tests and the Entero Well D–One system. In total, 61 isolates of E. coli were collected from September 2017 to January 2018 from water samples of the Almendares, Quibú and Luyanó rivers of Havana. A total of 90.1% of isolates identified had agreement between Entero Well D-One and conventional techniques for identification at genus and species level. Twenty seven different biochemical profiles were obtained between the E. coli strains. The 63.6% presented atypical profiles due to the negative reaction of the biochemical tests like production of the β-D-galactosidase enzyme, decarboxylation of the aminoacids lysine and ornithine and use of sorbitol. The presence of E. coli strains with atypical biochemical profiles shows that E. coli pathotypes could be found in the waters of the rivers of Havana and therefore the use of these waters implies a hygienic-sanitary risk.